Estudio en profundidad a través de redes de coocurrencia de los cambios ocurridos en la estructura bacteriana en suelos de diferentes sistemas de cultivo

Abstract

[SPA] Debido al desgaste de los suelos por el uso indiscriminado de pesticidas y herbicidas, la búsqueda de alternativas a la agricultura convencional ha ido ganando interés alrededor del mundo. En este sentido, los microorganismos son importantes, ya que están incluidos en muchas funciones indispensables en los suelos, como la fijación de nitrógeno. En este trabajo se estudiaron 3 tipos de agricultura diferentes i) convencional, ii) ecológica con estiércol y iii) ecológica con compost, con el objetivo de estudiar los cambios ocurridos en las comunidades bacterianas, así como su funcionalidad, las parcelas estaban ubicadas en Cartagena (España). Para estudiar estas funciones, se utilizó el gen 16S obtenido a través de la secuenciación masiva y seguidamente se realizaron aproximaciones matemáticas a través de PICRUSt para predecir la función de esos microorganismos en el suelo. Por otro lado, se realizó un análisis de redes ecológicas moleculares (MENA) para estudiar las interacciones entre esas bacterias. Los resultados de esta investigación mostraron como el compost puede incrementar algunas rutas metabólicas y puede influir en la organización bacteriana, favoreciendo la modulación y las conexiones entre los nodos.

[ENG] Due to soil degradation caused by indiscriminate use of pesticides and herbicides, search for sustainable alternatives to conventional agriculture has taken interest around the world. In this sense, microorganisms are important since they are involved in many indispensable functions on soils such a nitrogen fixation. In this work, three different cropping systems were studied i) conventional ii) organic with manure and iii) organic with compost, with the aim to study changes occurred on bacterial communities as well as their functionality. Experimental plots were located in Cartagena (Spain). To study these functions, 16S gen obtain through high-throughput then a mathematical approximations using PICRUST algorithm were used to predict functionality on soils. On the other hand, a molecular ecological network analysis (MENA) was made to study the interactions among these bacteria. Results of this research showed how compost can enhance some metabolic pathways and can influence the bacterial organization favoring modulation and connections among nodes.